流域综合治理与水经济发展研究中心起源于“三峡大学三峡经济研究中心”及“三峡区域经济社会可持续发展协同创新中心”，依托湖北省“十四五”特色优势学科群“资源生态管理与区域可持续发展”进行建设，聚焦省委省政府关切的重大问题和国民经济主战场的关键问题，以“服务长江、清江和汉江流域、服务湖北经济社会发展、服务学科建设、服务人才培养”为建设目标，以“实践、实证、实用”为建设思路，以高质量的科研教学为支撑，以制度建设为根本保证，建立了高效灵活的高层次人才引进和培养机制，汇聚了一批学风严谨、富有创新精神的学术骨干，围绕流域综合治理和水经济发展两大主题，形成了流域综合治理与可持续发展、涉水产业集聚与区域经济协调发展、流域水资源高效利用与生态治理、流域生态系统价值评估与环境保护四个研究方向，取得了一批学术研究成果，产生了较大的经济和社会效益。

2024年中心获批为湖北省高校人文社科重点研究基地。本中心现有学术委员会成员11人，其中院士1人、长江学者1人、优青1人。中心团队成员长期重视广泛学术交流与合作，通过学生联合培养、项目联合申报、团队互访、学术报告等多种形式，与上海交通大学、武汉大学、天津大学、山东大学、河海大学、郑州大学、云南大学、广东工业大学、美国加州大学伯克利分校、荷兰特温特大学、加拿大多伦多大学、滑铁卢大学和萨斯喀彻温大学等国内外知名院校相关学科领域的多位学者及水利部长江水利委员会、水利部发展研究中心等相关部门保持着良好的交流联系，密切关注水资源管理与区域可持续发展研究前沿和国家战略需求。